Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FmodP50608 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FmodP50608 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FmodP50608 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FmodP50608 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FmodP50608 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FmodP50608 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FmodP50608 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FmodP50608 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FmodP50608 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FmodP50608 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FmodP50608 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FmodP50608 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FmodP50608 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FmodP50608 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FmodP50608 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FmodP50608 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FmodP50608 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FmodP50608 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FmodP50608 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FmodP50608 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FmodP50608 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FmodP50608 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FmodP50608 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FmodP50608 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FmodP50608 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FmodP50608 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FmodP50608 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FmodP50608 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FmodP50608 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FmodP50608 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FmodP50608 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FmodP50608 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FmodP50608 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FmodP50608 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FmodP50608 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FmodP50608 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FmodP50608 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FmodP50608 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FmodP50608 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FmodP50608 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FmodP50608 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FmodP50608 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FmodP50608 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FmodP50608 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FmodP50608 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FmodP50608 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FmodP50608 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FmodP50608 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FmodP50608 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FmodP50608 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FmodP50608 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FmodP50608 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FmodP50608 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FmodP50608 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FmodP50608 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FmodP50608 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FmodP50608 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FmodP50608 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FmodP50608 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FmodP50608 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FmodP50608 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FmodP50608 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FmodP50608 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FmodP50608 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FmodP50608 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FmodP50608 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FmodP50608 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FmodP50608 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FmodP50608 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FmodP50608 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FmodP50608 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FmodP50608 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FmodP50608 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FmodP50608 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FmodP50608 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FmodP50608 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FmodP50608 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FmodP50608 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FmodP50608 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FmodP50608 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FmodP50608 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FmodP50608 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FmodP50608 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FmodP50608 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FmodP50608 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FmodP50608 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FmodP50608 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FmodP50608 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FmodP50608 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FmodP50608 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FmodP50608 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FmodP50608 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FmodP50608 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FmodP50608 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FmodP50608 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FmodP50608 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FmodP50608 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FmodP50608 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FmodP50608 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms