Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf10P50592 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf10P50592 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf10P50592 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf10P50592 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf10P50592 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf10P50592 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf10P50592 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf10P50592 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms