Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VegfbP49766 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VegfbP49766 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VegfbP49766 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VegfbP49766 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VegfbP49766 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VegfbP49766 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VegfbP49766 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VegfbP49766 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VegfbP49766 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VegfbP49766 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VegfbP49766 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VegfbP49766 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VegfbP49766 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VegfbP49766 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms