Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HpdP49429 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpdP49429 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpdP49429 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpdP49429 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpdP49429 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpdP49429 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpdP49429 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HpdP49429 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HpdP49429 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HpdP49429 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HpdP49429 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HpdP49429 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HpdP49429 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HpdP49429 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HpdP49429 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HpdP49429 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HpdP49429 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HpdP49429 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HpdP49429 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HpdP49429 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HpdP49429 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HpdP49429 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HpdP49429 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HpdP49429 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HpdP49429 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HpdP49429 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HpdP49429 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HpdP49429 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HpdP49429 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HpdP49429 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HpdP49429 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HpdP49429 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HpdP49429 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HpdP49429 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HpdP49429 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HpdP49429 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HpdP49429 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HpdP49429 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HpdP49429 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HpdP49429 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HpdP49429 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HpdP49429 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HpdP49429 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HpdP49429 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HpdP49429 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpdP49429 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpdP49429 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpdP49429 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpdP49429 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpdP49429 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpdP49429 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpdP49429 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpdP49429 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpdP49429 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpdP49429 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HpdP49429 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HpdP49429 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HpdP49429 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HpdP49429 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HpdP49429 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HpdP49429 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HpdP49429 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HpdP49429 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HpdP49429 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HpdP49429 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HpdP49429 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HpdP49429 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HpdP49429 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HpdP49429 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HpdP49429 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HpdP49429 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpdP49429 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpdP49429 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpdP49429 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpdP49429 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpdP49429 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpdP49429 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpdP49429 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpdP49429 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpdP49429 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpdP49429 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpdP49429 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpdP49429 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpdP49429 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpdP49429 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HpdP49429 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HpdP49429 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HpdP49429 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HpdP49429 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HpdP49429 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HpdP49429 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpdP49429 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpdP49429 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpdP49429 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpdP49429 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HpdP49429 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HpdP49429 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HpdP49429 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HpdP49429 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms