Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cox8bP48772 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox8bP48772 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms