Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx1P48377 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfx1P48377 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx1P48377 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx1P48377 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms