Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl11P48298 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl11P48298 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms