Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl5P47962 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl5P47962 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl5P47962 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl5P47962 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms