Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Igfbp3P47878 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Igfbp3P47878 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igfbp3P47878 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Igfbp3P47878 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms