Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf1P46099 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf1P46099 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klf1P46099 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klf1P46099 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klf1P46099 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klf1P46099 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klf1P46099 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf1P46099 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf1P46099 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf1P46099 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms