Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtgfrP43117 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtgfrP43117 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtgfrP43117 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms