Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tac1P41539 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tac1P41539 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tac1P41539 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tac1P41539 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tac1P41539 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tac1P41539 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tac1P41539 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tac1P41539 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tac1P41539 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tac1P41539 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tac1P41539 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tac1P41539 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tac1P41539 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tac1P41539 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tac1P41539 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tac1P41539 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tac1P41539 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tac1P41539 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tac1P41539 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tac1P41539 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms