Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik2P39087 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik2P39087 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik2P39087 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik2P39087 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik2P39087 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik2P39087 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik2P39087 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik2P39087 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik2P39087 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik2P39087 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik2P39087 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms