Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtlP38585 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtlP38585 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtlP38585 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtlP38585 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtlP38585 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtlP38585 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtlP38585 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtlP38585 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtlP38585 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtlP38585 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtlP38585 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtlP38585 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtlP38585 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtlP38585 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtlP38585 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtlP38585 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TtlP38585 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TtlP38585 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TtlP38585 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TtlP38585 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TtlP38585 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtlP38585 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtlP38585 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtlP38585 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TtlP38585 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TtlP38585 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TtlP38585 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TtlP38585 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TtlP38585 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TtlP38585 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TtlP38585 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtlP38585 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtlP38585 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtlP38585 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtlP38585 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtlP38585 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtlP38585 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtlP38585 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TtlP38585 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtlP38585 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TtlP38585 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TtlP38585 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TtlP38585 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TtlP38585 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TtlP38585 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TtlP38585 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TtlP38585 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TtlP38585 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TtlP38585 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TtlP38585 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TtlP38585 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TtlP38585 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TtlP38585 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TtlP38585 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtlP38585 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtlP38585 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtlP38585 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtlP38585 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtlP38585 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TtlP38585 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtlP38585 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtlP38585 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtlP38585 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtlP38585 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtlP38585 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtlP38585 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TtlP38585 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TtlP38585 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TtlP38585 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TtlP38585 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TtlP38585 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtlP38585 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtlP38585 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtlP38585 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtlP38585 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtlP38585 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtlP38585 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtlP38585 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtlP38585 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtlP38585 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtlP38585 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtlP38585 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtlP38585 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtlP38585 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtlP38585 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtlP38585 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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