Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig1P37913 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lig1P37913 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lig1P37913 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lig1P37913 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig1P37913 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lig1P37913 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig1P37913 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig1P37913 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig1P37913 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig1P37913 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms