Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfc1P35601 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc1P35601 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc1P35601 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms