Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin1P35438 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin1P35438 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin1P35438 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin1P35438 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin1P35438 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin1P35438 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin1P35438 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin1P35438 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin1P35438 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin1P35438 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin1P35438 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin1P35438 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin1P35438 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin1P35438 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms