Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc1P34928 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoc1P34928 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc1P34928 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms