Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptk2P34152 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptk2P34152 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptk2P34152 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptk2P34152 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2P34152 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2P34152 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2P34152 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2P34152 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2P34152 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2P34152 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptk2P34152 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptk2P34152 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptk2P34152 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms