Protein–RNA interactions for Protein: P33434

Mmp2, 72 kDa type IV collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp2P33434 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp2P33434 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp2P33434 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp2P33434 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms