Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc5P32043 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc5P32043 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc5P32043 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc5P32043 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc5P32043 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc5P32043 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc5P32043 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc5P32043 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc5P32043 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms