Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vcam1P29533 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vcam1P29533 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcam1P29533 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.3 ms