Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp3P28862 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp3P28862 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp3P28862 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms