Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RxraP28700 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxraP28700 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RxraP28700 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxraP28700 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxraP28700 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxraP28700 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxraP28700 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxraP28700 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxraP28700 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxraP28700 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxraP28700 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxraP28700 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxraP28700 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxraP28700 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxraP28700 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxraP28700 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxraP28700 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxraP28700 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxraP28700 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxraP28700 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxraP28700 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxraP28700 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RxraP28700 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxraP28700 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxraP28700 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxraP28700 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxraP28700 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxraP28700 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxraP28700 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxraP28700 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxraP28700 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxraP28700 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxraP28700 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxraP28700 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxraP28700 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxraP28700 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxraP28700 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxraP28700 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxraP28700 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RxraP28700 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxraP28700 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxraP28700 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxraP28700 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxraP28700 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxraP28700 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxraP28700 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxraP28700 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxraP28700 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxraP28700 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxraP28700 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxraP28700 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxraP28700 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxraP28700 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxraP28700 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxraP28700 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxraP28700 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxraP28700 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxraP28700 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxraP28700 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxraP28700 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxraP28700 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RxraP28700 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RxraP28700 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxraP28700 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxraP28700 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxraP28700 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxraP28700 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxraP28700 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxraP28700 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxraP28700 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxraP28700 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxraP28700 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxraP28700 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxraP28700 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxraP28700 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RxraP28700 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms