Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apex1P28352 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apex1P28352 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apex1P28352 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apex1P28352 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apex1P28352 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apex1P28352 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apex1P28352 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apex1P28352 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms