Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa5P28312 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa5P28312 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa5P28312 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa5P28312 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa5P28312 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa5P28312 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa5P28312 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa5P28312 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa5P28312 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms