Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa3P28310 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa3P28310 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa3P28310 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa3P28310 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa3P28310 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa3P28310 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa3P28310 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa3P28310 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa3P28310 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa3P28310 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa3P28310 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms