Protein–RNA interactions for Protein: P27546

Map4, Microtubule-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map4P27546 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Map4P27546 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Map4P27546 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Map4P27546 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Map4P27546 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Map4P27546 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Map4P27546 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Map4P27546 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Map4P27546 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Map4P27546 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Map4P27546 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map4P27546 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map4P27546 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map4P27546 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map4P27546 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map4P27546 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map4P27546 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map4P27546 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map4P27546 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map4P27546 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map4P27546 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map4P27546 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map4P27546 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map4P27546 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Map4P27546 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Map4P27546 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Map4P27546 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Map4P27546 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Map4P27546 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Map4P27546 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Map4P27546 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Map4P27546 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Map4P27546 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Map4P27546 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Map4P27546 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Map4P27546 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Map4P27546 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Map4P27546 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Map4P27546 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Map4P27546 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Map4P27546 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Map4P27546 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Map4P27546 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Map4P27546 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Map4P27546 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Map4P27546 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Map4P27546 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Map4P27546 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Map4P27546 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Map4P27546 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Map4P27546 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Map4P27546 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Map4P27546 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Map4P27546 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Map4P27546 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Map4P27546 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Map4P27546 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Map4P27546 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Map4P27546 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Map4P27546 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Map4P27546 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Map4P27546 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Map4P27546 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Map4P27546 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Map4P27546 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Map4P27546 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map4P27546 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map4P27546 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map4P27546 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map4P27546 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map4P27546 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Map4P27546 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Map4P27546 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Map4P27546 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Map4P27546 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Map4P27546 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Map4P27546 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Map4P27546 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Map4P27546 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Map4P27546 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map4P27546 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map4P27546 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Map4P27546 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Map4P27546 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Map4P27546 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Map4P27546 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Map4P27546 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Map4P27546 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Map4P27546 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Map4P27546 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Map4P27546 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map4P27546 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map4P27546 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map4P27546 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map4P27546 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Map4P27546 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Map4P27546 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Map4P27546 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Map4P27546 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Map4P27546 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms