Protein–RNA interactions for Protein: P26450

Pik3r1, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r1P26450 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3r1P26450 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3r1P26450 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pik3r1P26450 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3r1P26450 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms