Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CftrP26361 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CftrP26361 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CftrP26361 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CftrP26361 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CftrP26361 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CftrP26361 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CftrP26361 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CftrP26361 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CftrP26361 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CftrP26361 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CftrP26361 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CftrP26361 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CftrP26361 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CftrP26361 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CftrP26361 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CftrP26361 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CftrP26361 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CftrP26361 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CftrP26361 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CftrP26361 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CftrP26361 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CftrP26361 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CftrP26361 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CftrP26361 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CftrP26361 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CftrP26361 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CftrP26361 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CftrP26361 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CftrP26361 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CftrP26361 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CftrP26361 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CftrP26361 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CftrP26361 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CftrP26361 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CftrP26361 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CftrP26361 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CftrP26361 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
CftrP26361 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CftrP26361 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CftrP26361 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CftrP26361 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CftrP26361 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CftrP26361 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CftrP26361 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CftrP26361 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CftrP26361 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CftrP26361 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CftrP26361 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CftrP26361 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CftrP26361 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CftrP26361 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CftrP26361 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CftrP26361 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CftrP26361 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CftrP26361 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CftrP26361 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CftrP26361 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CftrP26361 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CftrP26361 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CftrP26361 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CftrP26361 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CftrP26361 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CftrP26361 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CftrP26361 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CftrP26361 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CftrP26361 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CftrP26361 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CftrP26361 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CftrP26361 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CftrP26361 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CftrP26361 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CftrP26361 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CftrP26361 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CftrP26361 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CftrP26361 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CftrP26361 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CftrP26361 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CftrP26361 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CftrP26361 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CftrP26361 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CftrP26361 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CftrP26361 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CftrP26361 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CftrP26361 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CftrP26361 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CftrP26361 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CftrP26361 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CftrP26361 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CftrP26361 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CftrP26361 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CftrP26361 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CftrP26361 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CftrP26361 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CftrP26361 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CftrP26361 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CftrP26361 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CftrP26361 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CftrP26361 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CftrP26361 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms