Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bmi1P25916 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms