Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pax3P24610 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pax3P24610 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pax3P24610 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pax3P24610 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pax3P24610 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pax3P24610 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax3P24610 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pax3P24610 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax3P24610 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax3P24610 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax3P24610 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax3P24610 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax3P24610 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax3P24610 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pax3P24610 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pax3P24610 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax3P24610 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax3P24610 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms