Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfyaP23708 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfyaP23708 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfyaP23708 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfyaP23708 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfyaP23708 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms