Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf8P23611 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf8P23611 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf8P23611 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf8P23611 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf8P23611 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf8P23611 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf8P23611 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf8P23611 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irf8P23611 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf8P23611 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf8P23611 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf8P23611 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms