Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja1P23242 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja1P23242 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja1P23242 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja1P23242 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja1P23242 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja1P23242 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja1P23242 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja1P23242 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja1P23242 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja1P23242 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja1P23242 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja1P23242 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms