Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ms4a2P20490 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ms4a2P20490 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ms4a2P20490 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ms4a2P20490 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms