Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP20293 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP20293 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP20293 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP20293 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TP20293 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP20293 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP20293 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP20293 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP20293 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP20293 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP20293 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP20293 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP20293 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP20293 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TP20293 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP20293 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP20293 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TP20293 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP20293 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP20293 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP20293 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP20293 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP20293 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP20293 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP20293 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TP20293 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP20293 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP20293 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP20293 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP20293 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TP20293 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TP20293 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP20293 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP20293 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP20293 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP20293 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP20293 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TP20293 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP20293 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP20293 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP20293 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP20293 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP20293 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TP20293 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TP20293 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP20293 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP20293 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP20293 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP20293 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TP20293 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP20293 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP20293 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP20293 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP20293 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP20293 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP20293 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP20293 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP20293 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP20293 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP20293 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP20293 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP20293 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP20293 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP20293 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP20293 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP20293 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP20293 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP20293 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP20293 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP20293 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP20293 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP20293 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP20293 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP20293 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP20293 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP20293 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TP20293 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP20293 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TP20293 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP20293 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP20293 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP20293 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP20293 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP20293 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP20293 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP20293 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TP20293 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TP20293 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms