Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VimP20152 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VimP20152 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VimP20152 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VimP20152 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VimP20152 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VimP20152 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VimP20152 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VimP20152 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VimP20152 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VimP20152 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VimP20152 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VimP20152 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VimP20152 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VimP20152 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VimP20152 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VimP20152 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VimP20152 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VimP20152 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VimP20152 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VimP20152 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VimP20152 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VimP20152 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VimP20152 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VimP20152 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VimP20152 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VimP20152 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VimP20152 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VimP20152 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VimP20152 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VimP20152 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VimP20152 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VimP20152 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VimP20152 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VimP20152 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VimP20152 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VimP20152 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VimP20152 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VimP20152 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VimP20152 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VimP20152 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VimP20152 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VimP20152 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VimP20152 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VimP20152 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VimP20152 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VimP20152 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VimP20152 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VimP20152 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VimP20152 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VimP20152 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VimP20152 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VimP20152 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VimP20152 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VimP20152 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VimP20152 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VimP20152 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VimP20152 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VimP20152 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VimP20152 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VimP20152 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VimP20152 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VimP20152 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VimP20152 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VimP20152 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VimP20152 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VimP20152 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VimP20152 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VimP20152 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VimP20152 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VimP20152 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VimP20152 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VimP20152 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VimP20152 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VimP20152 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VimP20152 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VimP20152 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VimP20152 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VimP20152 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VimP20152 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VimP20152 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VimP20152 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VimP20152 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VimP20152 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VimP20152 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VimP20152 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VimP20152 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VimP20152 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VimP20152 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VimP20152 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VimP20152 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VimP20152 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VimP20152 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VimP20152 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VimP20152 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VimP20152 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VimP20152 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VimP20152 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VimP20152 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VimP20152 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms