Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csn1s1P19228 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csn1s1P19228 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms