Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra6P16305 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra6P16305 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra6P16305 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra6P16305 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra6P16305 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra6P16305 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra6P16305 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabra6P16305 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra6P16305 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms