Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrphP15331 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrphP15331 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrphP15331 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrphP15331 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrphP15331 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrphP15331 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrphP15331 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrphP15331 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrphP15331 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrphP15331 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrphP15331 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrphP15331 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrphP15331 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrphP15331 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrphP15331 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrphP15331 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrphP15331 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrphP15331 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrphP15331 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrphP15331 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrphP15331 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrphP15331 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrphP15331 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrphP15331 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrphP15331 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrphP15331 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrphP15331 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrphP15331 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrphP15331 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrphP15331 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrphP15331 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrphP15331 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrphP15331 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrphP15331 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrphP15331 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrphP15331 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrphP15331 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrphP15331 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrphP15331 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrphP15331 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrphP15331 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrphP15331 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PrphP15331 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrphP15331 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrphP15331 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrphP15331 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrphP15331 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrphP15331 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrphP15331 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrphP15331 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrphP15331 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrphP15331 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrphP15331 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrphP15331 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrphP15331 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrphP15331 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrphP15331 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrphP15331 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrphP15331 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrphP15331 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrphP15331 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrphP15331 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrphP15331 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrphP15331 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrphP15331 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrphP15331 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrphP15331 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrphP15331 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrphP15331 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrphP15331 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrphP15331 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrphP15331 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrphP15331 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrphP15331 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrphP15331 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PrphP15331 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrphP15331 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrphP15331 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrphP15331 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrphP15331 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrphP15331 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrphP15331 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrphP15331 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrphP15331 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrphP15331 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrphP15331 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrphP15331 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms