Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb2P13373 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb2P13373 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb2P13373 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms