Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg5P12961 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scg5P12961 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg5P12961 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg5P12961 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scg5P12961 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scg5P12961 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.5 ms