Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P10404 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P10404 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P10404 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P10404 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P10404 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P10404 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P10404 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P10404 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P10404 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P10404 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P10404 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P10404 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P10404 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P10404 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P10404 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P10404 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P10404 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P10404 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P10404 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P10404 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P10404 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P10404 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P10404 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P10404 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P10404 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P10404 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P10404 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P10404 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P10404 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P10404 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P10404 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P10404 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P10404 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P10404 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P10404 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P10404 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P10404 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P10404 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P10404 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P10404 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P10404 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P10404 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P10404 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P10404 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P10404 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P10404 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P10404 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P10404 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P10404 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P10404 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P10404 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P10404 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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