Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Calm3P0DP28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calm3P0DP28 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calm3P0DP28 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calm3P0DP28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calm3P0DP28 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calm3P0DP28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms