Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Surf1P09925 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Surf1P09925 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Surf1P09925 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Surf1P09925 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Surf1P09925 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Surf1P09925 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Surf1P09925 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Surf1P09925 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Surf1P09925 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Surf1P09925 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Surf1P09925 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Surf1P09925 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Surf1P09925 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms