Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf3P09920 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf3P09920 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csf3P09920 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csf3P09920 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3P09920 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csf3P09920 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3P09920 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3P09920 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3P09920 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3P09920 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3P09920 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3P09920 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3P09920 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms