Protein–RNA interactions for Protein: P08399

Phxr5, Putative per-hexamer repeat protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phxr5P08399 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phxr5P08399 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phxr5P08399 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms