Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TtrP07309 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtrP07309 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtrP07309 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtrP07309 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TtrP07309 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TtrP07309 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtrP07309 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtrP07309 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtrP07309 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtrP07309 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtrP07309 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TtrP07309 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TtrP07309 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtrP07309 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtrP07309 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtrP07309 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtrP07309 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtrP07309 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TtrP07309 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TtrP07309 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtrP07309 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtrP07309 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TtrP07309 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TtrP07309 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtrP07309 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtrP07309 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtrP07309 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtrP07309 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TtrP07309 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtrP07309 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtrP07309 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtrP07309 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtrP07309 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TtrP07309 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtrP07309 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TtrP07309 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TtrP07309 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtrP07309 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtrP07309 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtrP07309 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TtrP07309 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtrP07309 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TtrP07309 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtrP07309 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtrP07309 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtrP07309 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms