Protein–RNA interactions for Protein: P06327

Gm5629, Ig heavy chain V region VH558 A1/A4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5629P06327 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5629P06327 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5629P06327 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms